La formation sera divisée en deux demi-journées.

Première demi-journée :

1. Rappel sur les bases de la ligne de commande sous Linux
2. Manipulation de fichiers, droits, archivage, compression, transferts
3. Le chaînage des opérations pour la construction de pipelines
4. Utilisation du cluster (soumission de tâches, monitoring...)

1. Les expressions régulières pour la recherche de motifs de texte
2. Outils simples de manipulation massive de texte (tail, grep, cut...)
3. Manipulation de texte avancée avec les outils sed et awk

• Vous êtes (*) : Prénom Nom de famille
• Votre status (*) :
  Etudiant
  Chercheur
  ITA
• Unité (*) :
  ISE-M
  CBGP
  MIVEGEC
  CEFE
  AMAP
  ECO & SOLS
  LAMETA
  CBAE
  ECOTRON
• Organisme principal de tutelle (*) :
  UM2
  CNRS
  IRD
  UM1
  INRA
  SUPAGRO
  CIRAD
  EPHE
• E-mail (*):
• Utilisez-vous BASH régulièrement ?
  plusieurs fois par semaine
  plusieurs fois par mois
  quelques fois par an
  jamais
• Depuis combien de temps utilisez-vous BASH ?
  moins d'un an
  moins de 3 ans
  plus de 3 ans
• Utilisez-vous déjà un cluster de calcul ?
  oui
  non
• Vous utilisez ou souhaitez utiliser un cluster pour (plusieurs choix possibles) :
  NGS
  statistiques
  simulation
  écologie
  autres
• Quelles sont vos attentes pour cette formation ? (facultatif)
• Type this captcha before submitting the form