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Basic Tree Thinking Assessment

 

This quiz includes a number of multiple-choice questions you can use to test yourself on your ability to accurately interpret evolutionary trees. Insofar as real biological examples have been used they are accurate based on current knowledge.

Author(s)

David A. Baum, Stacey DeWitt Smith, Samuel S. Donovan


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Formation Introduction à la phylogénétique et la génomique avec R

Phylogenetic reconstruction

 

Documents et liens relatifs à la formation "Introduction à la phylogénétique et la génomique avec R" organisée par Mbb du 26 au 28 mars 2014 à Montpellier. La partie adGenet de Thibaut Jombart est disponible : http://adegenet.r-forge.r-project.org/documentation.html .
Les diapos de l'intervention d'Emmanuel Paradis sont à télécharger ici.

Author(s)

Emmanuel Paradis


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Phylogenetic reconstruction




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L’alignement de séquences

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L’alignement de séquences et la sélection des blocks conservés

Author(s)

Delsuc F.


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Les méthodes probabilistes en phylogénie moléculaire. (1)

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Les modèles d évolution des séquences et le maximum de vraisemblance. Biosystema : « Avenir et pertinence des méthodes d’analyses en phylogénie moléculaire » 22: 59-74

Author(s)

Delsuc F. and Douzery E.J.P.


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Les méthodes probabilistes en phylogénie moléculaire. (2)

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L’approche Bayésienne. Biosystema : « Avenir et pertinence des méthodes d’analyses en phylogénie moléculaire » 22: 75-86.

Author(s)

Delsuc F. and Douzery E.J.P.


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Les modèles d’évolution

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Les modèles d’évolution des séquences et le choix du modèle optimal

Author(s)

Delsuc F


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Mammalian Phylogenomics

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When phylogeny meets genomics for an European cource on Comparative genomics

Author(s)

Douzery E.


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